根据区卫生局党委的统一部署和要求，从2008年12月开始我院深入学习实践科学发展观活动进入第二阶段(分析检查阶段)，在工作中，院党支部准确把握具体要求和工作任务，围绕中心，周密部署，精心组织，重点抓好广泛征求意见、找准突出问题、撰写领导班子分析检查报告、召开专题民主生活会和组织生活会、组织群众评议等五个环节工作，把深入学习实践科学发展观活动进一步引向深入，圆满完成了第二阶段的工作任务。
一、召开转段工作动员会。
2008年12月5日，我院召开了学习实践活动第二阶段转段动员大会，党员及中层以上干部参加了会议。在总结第一阶段工作的同时，对第二阶段（分析检查阶段）的工作进行了部署。王跃平局长对我院第一阶段工作给予充分肯定，并对接下来的学习实践活动提出明确的要求。
二、广泛征求意见，认真查找问题，为找准制约医院发展的突出矛盾和主要问题做好充分准备
为了对照贯彻落实科学发展观的要求，紧密联系医院工作发展实际，认真查找存在的突出问题，院党支部通过召开座谈会、问卷调查、设置意见箱等多种形式，在解放思想大讨论活动征求意见的基础上，广泛征求社会各界对班子成员在落实科学发展观方面的意见。征求意见的范围主要是医院干部群众、辖区社会监督员以及服务对象。共发放征求意见表50份，收回征求意见表50份，收集到意见、建议经过整理共12条，进一步找准了制约医院工作科学发展的突出矛盾和主要问题。通过征求意见，获取了大量的信息，为下一步剖析问题、查找差距、明确目标、制定措施提供了大量的基础性材料。
在征求意见过程中，院党支部能够结合局09年“质量绩效管理年”活动的要求，密切联系医院工作实际，找准切入点，认真查找在行政管理、经济管理和业务管理方面的问题。将征求意见、查找问题与群众评议活动紧密结合起来，促进了整体医疗卫生服务水平提升。
三、坚持实事求是，认真检查分析，形成班子分析检查报告。
根据所收集的对领导班子的意见和建议以及班子自身的深刻查找，认真撰写了《福田区第二人民医院领导班子分析检查报告》，报告中包含班子贯彻落实科学发展观的基本情况、存在的主要问题、存在问题的原因、整改措施和努力方向四个部分。报告形成后，召开支部扩大会议，组织党员干部群众和服务对象进行评议，发放征求意见表50份，收回50份，又将评议中提出的意见和建议进行汇总后体现到修改后的分析检查报告中，将分析检查报告和评议结果面向全院和社会广泛公开。《福田区第二人民医院领导班子分析检查报告》的形成，深刻分析和查摆了问题，理清了科学发展的思路，对医院今后的工作具有指导性意义。
四、精心组织专题民主生活会，深入开展批评与自我批评。
为了确保民主生活会的质量，进一步提高会议效率，在召开民主生活会前，对广泛征求到的党内外干部群众的意见，进行汇总和梳理，提交民主生活会时使用。会前，班子成员认真自学了相关文件精神，各自在分管范围内深入开展交心谈心活动，根据征求到的意见和建议，针对存在的突出问题，联系个人思想和工作实际，认真准备了发言材料。
12月15日 在院部六楼会议室召开了领导班子民主生活会，党支部委员及职能科室负责人列席会议。会议主题为“对照科学发展，紧密联系实际，认真查找问题，推动工作开展”。班子成员按照民主生活会的主题，联系个人的思想和工作实际，认真总结一年来开展的工作，深入查找了自身存在的问题和不足，开展相互批评和自我批评。与会人员积极发言、畅所欲言，真正达到了敢说真话、直言不讳的效果。
会后，院党支部以党小组为单位召开专题组织生活会，组织党员按照科学发展观的要求，分析查找自身的差距和不足，明确努力方向。
五、采取多种形式，进行群众再评议。
12月12日，党支部组织医院党员和群众代表，以及社会监督员和服务对象代表，以座谈会形式对分析检查报告进行评议；征求对班子分析报告的意见建议，对报告进行书面评议；会后，为进一步扩大征求意见的范围，将分析检查报告在医院网站公示，广泛听取社会各界的意见。评议结合党员干部思想作风整顿、作风建设活动情况，着重从对科学发展观的认识深不深、查找的问题准不准、原因分析的适不透、发展思路清不清、工作措施可不可行等方面提出意见建议。
在分析检查阶段过程中，医院全体党员干部能够落实王跃平局长提出的“五个抓”，即抓住突出实践特色与当前主题紧密结合；抓住四个关键环节；抓住理论学习的主线，在实践中学习，向兄弟单位学习，向群众学习；抓住开门搞活动，走群众路线的工作方法。把学习实践科学发展观活动分析检查阶段各项工作推向深入，找准了制约医院科学发展的瓶颈问题，为第三阶段整改落实阶段奠定了基础。
2009年，在区委区政府及区卫生局领导下，全面落实科学发展观，围绕“质量绩效管理年”活动，在行政绩效、经济绩效、业务绩效三方面抓落实，并以活动为契机，以加快发展为主线，以学科建设为抓手，以“增强活力、注重规范、敢于创新” 为重点，在思考中寻思路、在实践中谋发展，增强各项工作的生机与活力，达到二级综合性医院的要求。